head pictures
  1. Nyitóoldal
  2. Kutatás
[Saját weboldal]

Molekuláris Biológiai és Bioinformatikai Kutatócsoport

A csoport vezetője

Málnási-Csizmadia András kutatóprofesszor

A csoport tagjai

Rauscher Anna posztdoktor

Végner László doktorjelölt

Kintses Bálint PhD hallgató

Zhenhui Yang

Papp Dániel

Várkuti Boglárka tudományos munkatárs

Aktivitás

Kutatási témák

Motor és jelátviteli enzimek működési mechanizmusának vizsgálata helyspecifikus fluoreszcens jelek és különböző tranziens kinetikai módszerek kombinálásával.

A miozin konformációs átmenetének kiváltása fénnyel indukálható molekuláris rugóval

Csoportunk szakterülete az enzimek molekuláris szintű hatásmechanizmusának vizsgálata, valamint molekulamodellezés és molekuláris bioinformatika. Új módszereket fejlesztünk ki annak vizsgálatára, hogy az enzimek egyes funkcionális régiói hogyan kommunikálnak egymással a molekulán belül. Nagy tapasztalattal rendelkezünk a tranziens kinetikai módszerek alkalmazásában, valamint az enzimek és ligandumaik szelektív kémiai módosításában. A Delta Informatika Zrt-vel közösen létrehozott bioinformatikai alcsoport önálló projektje (MIF) mellett kiterjedt in silico hátteret biztosít a molekuláris biológiai projektekben.

Motor és jelátviteli enzimek működési mechanizmusának vizsgálata helyspecifikus fluoreszcens jelek és különböző tranziens kinetikai módszerek kombinálásával.

Nagy megtiszteltetés számunkra, hogy az ebben a témában beadott „Intramolecular force mapping of enzymes in action: the role of strain in motor and signalling mechanisms” című projektünket az European Research Council, Európa legnagyobb tudományos presztizsű pályázata az elsők között támogatta. A projekt célja a miozin enzimatikus ciklusa során bekövetkező konformációs változások közötti funkcionális összefüggések feltárása, az egyes régiók közötti kommunikáció feltérképezése.

Együttműködések

Hazai

Kovács Mihály
(ELTE Biokémiai Tanszék)

Gráf László
(ELTE Biokémiai Tanszék)

Vértessy Beáta
(MTA Enzimológiai Intézet, Budapest)

Hári Péter
(DELTA Informatika Zrt., Budapest)

Kellermayer Miklós
(PTE Biofizikai Intézet, Pécs)

Derényi Imre
(ELTE Biofizikai Tanszék)

Vellai Tibor
(ELTE Genetikai Tanszék)

Nemzetközi

Clive R. Bagshaw
(University of Leicester, U. K.)

Michael A. Geeves
(University of Kent, U. K.)

James R. Sellers
(National Institutes of Health, USA)

Peter Fajer
(Florida State University, USA)

Roger Cooke
(UCSF, USA)

Laszlo Forro
(EPFL, Svájc)

Támogatók

European Research Council

NKTH

OTKA

Legfontosabb publikációk

  • Gyimesi, M., Kintses, B., Bodor, A., Perczel, A., Fischer, S., Bagshaw, C. R. & Málnási-Csizmadia, A.
    The mechanism of the reverse recovery step, phosphate release, and actin activation of Dictyostelium myosin II. (2008)
    J Biol Chem 283, 8153-63.
  • Kintses, B., Gyimesi, M., Pearson, D. S., Geeves, M. A., Zeng, W., Bagshaw, C. R. & Málnási-Csizmadia, A.
    Reversible movement of switch 1 loop of myosin determines actin interaction. (2007)
    Embo J 26, 265-74.
  • Kintses, B., Simon, Z., Gyimesi, M., Tóth, J., Jelinek, B., Niedetzky, C., Kovács, M. & Málnási-Csizmadia, A.
    Enzyme kinetics above denaturation temperature: a temperature-jump/stopped-flow apparatus. (2006)
    Biophys J 91, 4605-10.
  • Zeng, W., Conibear, P. B., Dickens, J. L., Cowie, R. A., Wakelin, S., Málnási-Csizmadia, A. & Bagshaw, C. R.
    Dynamics of actomyosin interactions in relation to the cross-bridge cycle. (2004)
    Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 359, 1843-55.
  • Conibear, P. B., Bagshaw, C. R., Fajer, P. G., Kovács, M. & Málnási-Csizmadia, A.
    Myosin cleft movement and its coupling to actomyosin dissociation. (2003)
    Nat Struct Biol 10, 831-5.