A csoport vezetője

Nyitray László egyetemi tanár

A csoport tagjai

Molnár Tamás egyetemi adjunktus

Kiss Bence tudományos munkatárs

Pohl Gábor PhD hallgató

Rapali Péter

Radnai László

Aktivitás

Kutatási témák

Miozin proximális S2 "coiled-coil" flexibilis szerkezete

Coiled-coil és magányos α-hélix szerkezeti motívumok

A motorfehérjék "farok régióját" felépítő coiled-coil szuperhélix szerkezetét és funkcióit tanulmányozzuk biofizikai és krisztallográfiai módszerekkel. A miozin VI korábban szintén coiled-coil szerkezetűnek jósolt doménjéról kimutattuk, hogy egyszálú, sókötésekkel stabilizált magányos α-hélix szerkezetű. Bioinformatikai módszerekkel azt találtuk, hogy a magányos α-hélix számos más fehérjében is megtalálható szerkezeti motívum. Meglepően nagy stabilitásukat in vitro és in silico módszerekkel vizsgáljuk.

Dinein könnyű lánc

A DLC (emlősökben DYNLL) egy eukarióta "hub" protein, amely a dinein és a miozin Va motorfehérjéken kívül több tucat más fehérjéhez is kapcsolódik. Érdekes módon a kötőpartner fehérjék vagy teljesen rendezetlen szerkezetűek, vagy a DLC-kötőpeptid egy szerkezetnélküli domén része. A DLC interakciós hálózatát proteomikai módszerekkel vizsgáljuk. A DLC "promiszkuitásának" molekuláris alapjaira NMR spektroszkópiai és röntgenkrisztallográfia módszerekkel keressük a választ. Az "optimális" DLC-kötő motívumot in vitro evolúcióval (fág-bemutatás kísérletek Pál Gáborral együttműködésben) keressük.

Konvencionális miozinok szabályozása

A miozin II motorfehérjék aktivitását a könnyű láncok Ca2+-kötése és/vagy reverzibilis foszforilációja szabályozza, amelynek a szerkezeti alapjait különböző eredetű, valamint kiméra miozinok segítségével vizsgáljuk. A „kikapcsolt” állapot nagyfelbontású szerkezetét nem ismerjük, ezért olyan rekombináns HMM (nehéz meromiozin) konstrukciókat próbálunk előállítani, amelyek kristályosítási célra alkalmasak. A filamentumképzést nem-izom miozin II motoroknál a C-terminális coiled-coil régióhoz kötődő, metasztatikus tumorokban megemelkedett expressziós szintet mutató S100A4 Ca2+-kötő fehérje is befolyásolja. A komplex szerkezetét és a szabályozásban betöltött szerepét vizsgáljuk.

Transzport miozinok kargókötése

Az intracalluláris transzportfolyamatokban fontos szerepet játszó V-ös és VI-os osztályba tartozó nem konvencionális miozinok kargókötésének molekuláris alapjait, a C-terminális helyzetű globuláris kargókötő domének (GTD) szerkezetét tanulmányozzuk. A kargókötést többek között reverzibilis foszforiláció szabályozza, másrészt a GTD is szabályozza a motor aktivitását. Az összetett szabályozási mechanizmus részleteit kutatjuk.

Együttműködések

Hazai

Nemzetközi

Támogatók

Legfontosabb publikációk

• Brown, J. H., Yang, Y., Reshetnikova, L., Gourinath, S., Süveges, D., Kardos, J., Hóbor, F., Reutzel, R., Nyitray, L. & Cohen, C.
  An unstable head-rod junction may promote folding into the compact off-state conformation of regulated myosins. (2008)
  J Mol Biol 375, 1434-43.
• Hódi, Z., Németh, A. L., Radnai, L., Hetényi, C., Schlett, K., Bodor, A., Perczel, A. & Nyitray, L.
  Alternatively spliced exon B of myosin Va is essential for binding the tail-associated light chain shared by dynein. (2006)
  Biochemistry 45, 12582-95.
• Debreczeni, J. E., Farkas, L., Harmat, V., Hetényi, C., Hajdú, I., Závodszky, P., Kohama, K. & Nyitray, L.
  Structural evidence for non-canonical binding of Ca2+ to a canonical EF-hand of a conventional myosin. (2005)
  J Biol Chem 280, 41458-64.
• Li, Y., Brown, J. H., Reshetnikova, L., Blazsek, A., Farkas, L., Nyitray, L. & Cohen, C.
  Visualization of an unstable coiled coil from the scallop myosin rod. (2003)
  Nature 424, 341-5.